该实验室于2006年7月26日由科技部认定，依托于中国科学院生态环境研究中心，是我国生态学领域的第一个国家重点实验室，欧阳志云研究员担任主任。实验室面向国家生态安全与可持续发展需求，凝聚了一批在国内外具有重要学术影响的生态学家，形成了一支以青年为主（45岁以下人员占89%）、创新能力强的研究团队，包括院士1名、研究员11名、副研究员13名等固定研究人员38人。

1.核心定位与研究：以城市与区域生态系统为对象，研究人类活动对生态系统结构、功能与过程的影响及调控机理，发展复合生态系统生态学的理论与方法。
2.目标与支撑：旨在为解决国家重大生态环境问题、促进城市与区域可持续发展提供关键的科学基础与技术支持。
3.对外服务：可在生态状况评价、城市及区域生态规划等方面对外提供专业服务。