中国科学院纳米生物效应与安全性重点实验室（纳米中心部分）于2008年12月认定，依托国家纳米科学中心建设，王琛任主任。实验室面向纳米材料生物效应的基础研究及国家战略性前瞻性需求，主要研究方向包括：1.生物环境下纳米材料性能及调控研究（揭示纳米材料与生物界面间相互作用及发展新的诊疗途径）；2.纳米结构的生物效应与分析研究（阐明纳米尺度生物分子、细胞的行为，发展生物效应检测及分析的新方法）；3.医用微纳系统与技术集成（发展低成本、实时现场的诊断和治疗系统）；4.生物医用分子工程及纳米技术（利用纳米材料靶向性增强治疗效果，降低药物毒副作用）；5.医用纳米材料及器件的有效性评价及安全性研究（建立权威的、标准化的纳米技术及其相关产品的有效性评价及安全评估体系）。实验室现有固定人员61人，其中研究员14人，国家杰出青年科学基金获得者5人，中国科学院"百人计划"7人，国家优秀青年科学基金获得者2人。骨干专家包括王琛研究员（扫描隧道显微术、单分子物理化学及分子自组装、多肽纳米结构的疾病检测与治疗）、蒋兴宇研究员（微流控和纳米材料生化分析）、梁兴杰研究员（纳米药物的设计合成、结构优化和功能测定及其临床应用）等。

1. 纳米材料生物效应研究与诊疗技术开发服务
开展生物环境下纳米材料性能及调控、纳米结构的生物效应与分析研究，揭示纳米材料与生物界面间相互作用，发展生物效应检测及分析的新方法，探索与纳米结构密切相关的生理、生化过程中的分子机制，为疾病诊疗提供新途径。
2. 医用微纳系统与纳米药物研发服务
针对普惠医疗体系的重大需求，利用微纳米器件的高灵敏、高通量和小型化特点，发展低成本、实时现场的诊断和治疗系统；开展生物医用分子工程及纳米技术研究，利用纳米材料靶向性增强治疗效果，有效降低药物毒副作用。
3. 纳米材料安全性评价与标准体系建设服务
建立权威的、标准化的纳米技术及其相关产品的有效性评价及安全评估体系，开展医用纳米材料及器件的有效性评价及安全性研究；培养优秀科研工作者，开展国内外学术交流，为纳米学科高水平基础研究提供平台支撑。