国家药用植物种质资源库于2006年1月由财政部认定成立，依托中国医学科学院药用植物研究所建设，主任为魏建和研究员。
实验室现有科研人员26名，包括研究员3名、副研究员6名、助理研究员3名，以及博士后和研究生14名。主任魏建和研究员为中国中医科学院中药学博士，博士生导师，研究方向为药用植物遗传育种及次生代谢产物合成调控，入选"万人计划"第一批科技创新领军人才。
实验室首次在世界上解析了"伤害诱导白木香防御反应形成沉香机制"，创新发明了世界领先的"通体结香技术"，建立了大规模产业化技术体系。创建了药用植物种质资源低温干燥保存技术体系，建成我国第一座药用植物专业种质库，收集保存全世界药用植物种质资源近3万份。
近5年获省部级科技特等奖、二等奖、三等奖各1项，国家科技进步二等奖1项（排名第4），发表论文180余篇（SCI 30余篇）。创新成果已在17省市、7个东南亚国家应用，经济效益15亿元以上。

国家药用植物种质资源库是目前国内最大、唯一运行的国家级药用植物专业种质库，面向全国开展以下技术服务：
1.野生、栽培、珍稀濒危药用植物种质资源收集与保存服务
2.种质资源交换和共享服务
3.药用植物种子质量检测技术服务（包括净度分析、水分测定、发芽试验、生活力测定、活力测定、重量测定等，检测实验室已获得CMA资质认定）
4.中药材遗传育种与良种繁育技术服务
5.沉香等珍稀南药诱导结香技术服务
6.药用植物种质资源离体保存及组织培养技术服务