天然药物生物合成卫生部重点实验室于1985年1月由国家计生委认定，依托中国医学科学院药物研究所建设，现任主任朱平教授。实验室现有科技人员和在读研究生等40余名，其中教授10名、副教授3名，博士生导师8名，硕士生导师5名。
领衔专家朱平：研究员，博士生导师，现任药物所生物合成室主任，国家卫生计生委天然药物生物合成重点实验室主任，药物化学系副主任，天然药物活性物质与功能国家重点实验室副主任，中国菌物学会副理事长，中国中药协会药用菌物专业委员会主任委员，《药学学报》等杂志编委。1988年中国协和医科大学微生物药物学专业研究生毕业，1991-1993年由欧共体资助在英国诺丁汉大学进修真菌生化及分子生物学。发表论文100多篇，包括在Nature Communications等国际知名期刊，累计授权7项中国专利和9项国际专利。
学术委员会主任由于德泉院士担任。

实验室主要研究目标是应用现代生物技术开展天然药物活性物质研究，解决制约天然药物生产的瓶颈问题和拓展天然药物的来源。目前的研究重点包括：
1、稀缺天然药物合成生物学研究；
2、生物催化重组酶研究；
3、动植物内共生菌活性代谢产物研究；
4、基因挖掘、酶的表征及其结构与功能关系研究。
合作发现3'-脱氧腺苷（虫草素）的降血脂功能及其作为AMPK激动剂的作用机制，已研制出新型降血脂药物并完成临床前研究和技术转让；麦角生物碱的研究为相关企业提供了技术支撑（菌种和技术）。