信息系统安全实验室于2018年3月由教育部认定，依托清华大学软件学院建设，现任主任王建民教授。学院设有软件工程一级学科，形成四个研究方向——"软件工程与系统"、"群智感知计算与物联网"、"大数据管理"和"CAD与可视化"。学院共有教师44名，其中中国工程院院士1名，2人入选国家"千人计划"，2人入选国家"万人计划"，1人获评长江学者特聘教授，5人获国家自然科学基金委杰出青年基金资助，5人获国家自然科学基金委优秀青年基金资助。王建民教授为国家杰出青年基金获得者、国家"万人计划"第一批科技创新领军人才，现任学院院长。

基于学院在软件工程领域长期的技术积累和研发实力，为企业和其他科研院所提供技术创新和软件研发服务。