中国中医科学院青蒿素研究中心于2016年6月由国家中医药管理局认定，依托中国中医科学院中药研究所建设，现任主任王继刚研究员。实验室拥有屠呦呦研究员（中国中医研究院终身研究员和首席研究员）王继刚（博士研究生导师，天然产物研究室主任）、廖福龙（研究员，博士生导师，专家委员会副主任委员，生物力药理学研究中心主任）等领衔专家。近年来在包括青蒿素在内的中药及天然产物的靶标、作用机理和抗药研究及细胞自噬药物筛选平台建立等方面取得了一系列研究进展与突破。

实验室主要开展以下研究与服务：
1、青蒿素作用机制研究：包括抗疟作用及其机制、青蒿素耐药机制研究、青蒿素的体内胞内代谢过程；
2、青蒿素类药物的新适应症研究开发：对免疫性疾病、肿瘤等功效评估，青蒿素联合制剂的研发；
3、青蒿素资源研究：青蒿素高含量的青蒿新植株培育，黄花蒿种质资源库建设。