针灸生理实验室是本系统认定实验室，于2009年7月13日认定，依托单位为中国中医科学院针灸研究所，主任为朱兵研究员。
实验室现有高级职称8名（研究员4名、副研究员3名、副主任技师2名），中级职称5名（助理研究员3名、主管技师2名），实习研究员4名，在读博士研究生2名，在读硕士3名。多名博士在海外获得博士学位，6名博士分别到美国、法国和香港进行博士后研究工作。先后培养博士研究生13名、硕士研究生16名，引进人才5名，培训人才6名，是国家教委批准的博士后流动站。骨干专家朱兵博士、研究员、博士生导师，主要方向为针灸的基础与临床。

一、神经电生理技术服务
提供玻璃微电极细胞外记录神经元单位放电、单细胞放电结合微电泳技术、膜片钳全细胞记录、大鼠延髓背侧网状亚核神经元细胞外放电记录、下丘脑与生殖内分泌功能相关的神经元判定等技术服务。
二、神经传导与功能测定服务
开展大鼠坐骨神经传导速度的测定、电解损毁核团方法、脑内核团微量注射、皮层/脊髓给药方法、胃内压与膀胱内压的检测、与内脏病变相关的皮肤反应点分布测定等技术服务。
三、动物行为与疼痛模型服务
提供辐射热-甩尾法、辐射热-举足法、机械压力-缩腿法测定动物伤害性刺激阈；开展辣椒素阻断针刺镇痛模型、药物性高血压模型、戊四氮致癫痫大鼠模型、大鼠慢性疼痛（CCI）模型制备及痛阈测定、记忆损伤模型制备等实验服务。
四、疾病动物模型制备服务
建立糖尿病合并脑缺血再灌注导致学习记忆障碍大鼠模型、大鼠心肌局部缺血模型、急性心肌缺血（AMI）再灌注性损伤模型、大鼠离体心脏模拟全心缺血模型、速发型糖尿病动物模型、胃溃疡模型、胆石症胆绞痛模型、脊髓横断损伤模型、佐剂性关节炎模型等多种疾病动物模型。
五、分子生物学与蛋白质组学服务
提供脊髓蛛网膜下腔插管、脑内微量注射比较蛋白质组学技术等分子生物学实验技术服务。