中医药信息数字化实验室是国家中医药管理局于2009年认定的省部级重点实验室，依托单位为中国中医科学院中医药信息研究所，主任为崔蒙研究员。
实验室是国家中医药信息数字化建设与研究的中心，致力于中医药信息学的学科建设、中医药信息数据库与网络建设、中医药信息数据的挖掘与利用研究、中医药信息标准化研究，以及中医药情报学及战略研究。
人才培养方面，实验室拥有中医学（中医基础理论）、管理学（图书馆、情报与档案管理）两个学科的学位授权点，已培养硕士15名、博士6名、博士后11名，并引进博士后人才10余名，形成交叉学科人才梯队。

一、数据库建设与共享服务
建设并运营中医药科技信息数据库、医药卫生科学数据管理与共享服务系统、中医药科学数据管理与共享服务中心等国家级数据平台，提供中医、中药、针灸、化学成分、中医药术语、标准、中医古籍等领域的专业信息检索服务，所有数据库通过Internet平台发布共享。
二、专业数据资源整合
整合古代中药与方剂数据库（含古代中药数据1万项、方剂7万项）、1949年以前中医药期刊文献数据库（收录期刊500余种、文献8万余篇）、海外中医古籍联合目录数据库（收集整理国外散失中医善本古籍题录2万余条）、中医药语言系统（整合术语10万条，占概念词65%）等核心资源。
三、产学研协同合作
与浙江大学计算机学院、中国中医科学院西苑医院、新疆维吾尔自治区维吾尔医药研究所、中国科学院大连化学物理研究所、黑龙江中医药大学第一附属医院等单位共建联合实验室，开展中医药数字化、中药新药筛选、文献平台建设等协同研究与技术服务。