中药药理实验室于2009年1月由国家中医药管理局认定，依托中国中医科学院西苑医院建设，刘建勋任主任。实验室建于1974年，是科技部规范化中药药理实验室、国家中医药管理局中药药理重点学科、中药药效评价方法学重点研究室、北京市中药药理重点实验室、中国生物技术创新服务（ABO）联盟成员。主要研究方向包括：1.中药药理；2.中药新药及作用机理研究。现有科研人员20名，其中院士1名、研究员3名、副研究员6名。骨干专家包括李连达院士（学术带头人，中药药理）、刘建勋研究员（学科带头人，中药新药及作用机理研究，建立的药效综合评价技术体系被国内广泛采用）等。

1. 中药药效评价与技术服务
建立适合中药特点的药效综合评价技术体系，搭建具有国内领先水平的中药药效学研究与评价平台，为国内外制药企业及研究单位评价药物上百种。开展心血管系统疾病（抗心肌缺血药、溶栓药、抗凝血药等）、脑血管系统疾病（中风、脑血管痴呆等）、神经退行性疾病（老年性痴呆、抑郁症、帕金森病等）、糖尿病及并发症、肿瘤、类风湿关节炎等疾病的中药新药药效评价服务。
2. 中药药效指标检测与平台支撑服务
提供中药药效指标检测服务，包括动物生化、神经递质、蛋白质组学、代谢组学等；依托膜片钳系统、微透析系统、QTRAP质谱、MALDI-TOF-MS等先进仪器，为中药研究领域提供技术支撑和平台服务。